Planta longitudinal com 3 naves de 7 tramos quase à mesma altura. Cabeceira da capela-mor poligonal, ladeada por 2 capelas, quadrangulares no exterior e interiormente poligonais. Cobertura diferenciada em 2 águas na nave central e 1 água nas laterais. Fachada com portal de arco quebrado encimado por grande rosácea.

Fundado em 1286 por D. Mor Dias, o Mosteiro de Santa Clara-a-Velha é pouco tempo depois encerrado por oposição dos monges de Santa Cruz, vindo a ser refundado por D. Isabel de Aragão em 1314, a qual renova e amplia os edifícios existentes, bem como se faz aqui sepultar. Posteriormente, e tendo-se intensificado o culto à Rainha Santa Isabel, o seu corpo e túmulo serão trasladados, em 1677, para o novo Mosteiro de Santa Clara-a-Nova.